普通话证书纸质版丢了是可以补办的，具体步骤如下：

1、根据规定，凡两年之内已接受过普通话测试中心组织的普通话水平测试，但普通话等级证书已遗失的可以申请补办普通话水平测试等级证书。

2、申请补办者需先填写《普通话水平测试等级证书补办申请表》提出申请，递交两张一寸近期免冠证件照。

3、填写完《补证申请表》后需本人所在单位盖章，然后到本人原测试报名点，由测试站点填妥审核意见并盖章、备案。

4、对申请补办者原有的录音资料及申请时所录的声音资料进行比照，于20个工作日之内给予办理。

所以普通话证书如果丢了也不要担心，可以通过正规流程进行补办。