政府雇员和事业单位雇员都属于雇员，指的是机关、事业单位在核定编制和名额内，以合同形式雇用的人员，都不属于编制。但两者在工作单位、福利待遇、作用上不同。政府雇员和事业单位雇员的福利待遇是相差不大的，根据岗位和单位自行设定。

1、工作单位不同

政府雇员在政府里面工作，与之共同工作的还有属于编制的公务员；事业单位雇员在事业单位工作，与之共同工作的还有事业单位人员。相对来说，福利补贴待遇就没有公务员编制和事业编制好。

2、福利待遇不同

政府雇员和事业单位雇员的福利待遇是相差不大的，根据岗位和单位自行设定。总的来说，公务员比事业编制好，事业编制比合同工即雇员好。总之，有编制比无编制好。存在高级雇员待遇是不错的，但是这个就看个别岗位的特殊性了。

3、作用不同

政府雇员不占用编制，压缩了政府人员规模，节约了政府运作成本，符合现代政府从大政府"向小政府"、从传统政府"向电子政府"转变的趋势，有助于建立起服务型政府模式；事业单位雇员也不占用编制，由事业单位招聘，工作内容也是由事业单位设定。